冠状病毒检测使用CRISPR在40分钟内检测疾病

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随着冠状病毒大流行的恶化,可靠、准确和快速的检测covid19已经成为控制传播和恢复生命的最重要的措施之一。“正常”。加州大学旧金山分校(University of California, San Francisco)和生物科技公司猛犸生物科学(Mammoth Biosciences)的研究人员开发了一种名为CRISPR的强大得令人难以置信的基因编辑工具。
 
周四发表在《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志上的新方法,是第一个同行评审的出版物,天辰注册平台表明CRISPR是一种可行的COVID-19诊断工具。基于crispr的系统被称为“Detectr”,可以将测试时间从大约5个小时减少到40分钟。
 
CRISPR经常被描述为“一把分子剪刀”,因为它能够精确地切割DNA。为了做到这一点,它利用了一个向导和一种可以被操纵的酶来寻找特定的DNA或RNA。这就像一枚基因序列的弹道导弹:你敲进坐标,然后CRISPR对它进行打磨,准备切割。
 
引起COVID-19的冠状病毒SARS-CoV-2是一种RNA病毒。通过对crispr -系统进行编程,找出SARS-CoV-2中的两个基因,研究团队表明,他们可以引导自己的系统识别患者样本中的冠状病毒。检测结果可以在侧流条上查看,这是一种显示阳性结果的简单线条标记的设备,就像验孕试纸一样。
 
在CDC确认阳性的40个样本中,Detectr发现了38个阳性。它错误地将2确定为阴性,显示95%与CDC当前的协议一致。在对42个阴性样本的分析中,Detectr没有将任何样本标记为假阳性。
 
“最初的结果……堪培拉澳大利亚国立大学的遗传学家Gaetan Burgio说。“总的来说,它有潜力。”
 
与CDC目前的方法相比,检测器的主要优势是速度。这两种测试都需要从病人身上提取相同的样本:从鼻子或喉咙处提取的拭子。但是疾病控制中心使用实时聚合酶链反应(RT-PCR)来检测冠状病毒,这需要一个庞大的机器,运行大约需要4个小时。Detectr能够在一个图形计算器大小的机器上运行,并且利用了一个快得多的方法。但是,它不能像CDC的协议那样执行那么多的并发测试。
 
“有一些缺点,”Burgio说。“RT-PCR技术的优势在于一次检测386个样本,天辰注册平台而CRISPR技术则不是这样。
 
“这不是一天测试3000次的方法。”
 
Burgio指出,这项检测还不能达到疾病预防控制中心使用的RT-PCR检测的灵敏度水平,还需要进一步确定其是否适合更大范围的应用,并获得FDA的批准。
 
COVID-19的一个关键问题是,可能携带病毒但没有症状的人所占的比例。即使他们感觉良好,他们可能会传播疾病。能够在检测和筛查中捕获这些人群对于确定可能在何处发生另一次暴发是非常宝贵的,而类似这样的快速、准确的检测可以帮助开展这方面的工作。
 
测试的突破对探测器系统本身也具有重要意义。猛犸象生物科学公司一直致力于将该工具开发成一系列疾病的诊断设备。如果出现另一种传染病,Detectr中使用的指南可以改变,以识别这种新的疾病,从而提供一个可以在几天内针对新出现的疾病重新配置的系统。
 
猛犸生物科学公司首席技术官Janice Chen表示,该
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